Development (Python API)

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  • Submodules
    • augur.align module
    • augur.ancestral module
    • augur.clades module
    • augur.distance module
      • Comparison methods
      • Distance maps
    • augur.export module
    • augur.filenames module
    • augur.filter module
    • augur.frequencies module
    • augur.frequency_estimators module
    • augur.lbi module
    • augur.mask module
    • augur.parse module
    • augur.reconstruct_sequences module
    • augur.refine module
    • augur.sequence_traits module
    • augur.titer_model module
    • augur.titers module
    • augur.traits module
    • augur.translate module
    • augur.tree module
    • augur.utils module
    • augur.validate module
    • augur.version module